崇明线工程起自浦东新区金吉路站，经申江路、高宝路、东靖路、长江口南港隧道、长兴岛永卫路、长江口北港隧道、崇明岛陈通路、朱雀路、繁郁路、中滨路，至终点裕安站。正线全长42.317千米。线路南起浦东金桥地区，利用新建越江隧道跨越长江口南港和北港，途经长兴岛中部新开港及陆域，最终到达崇明陈家镇。线路主要沿申江路-高宝路-东靖路-长江南港-永卫路-长江北港-陈通路-生态实验社区内朱雀路-商务休闲片区内规划繁郁路-中滨路东侧走行。过江段分别在现状长江隧道、大桥东侧新建直径13m盾构隧道，南港段新建隧道长7.739km，北港段新建隧道长9.024km。线路全长42.317km，车站8座，均为地下站。规划换乘站2座，分别在金吉路站与轨道交通9号线换乘，在申江路站与轨道交通12号线换乘。全线设东靖路车辆段和陈家镇停车场，设三座主变电所（金桥主变电所、长兴岛主变电所和陈家镇主变电所），控制中心设于C3大楼
